Anaconda
- Moduli za nalaganje:
module load Anaconda3/2021.11
- na primer, ustvarite novo okolje z imenom myenvironment za python 3.9.7
conda create --quiet --yes --name myenvironment python=3.9.7
- aktivirati okolje:
conda activate myenvironment
- preveri okolje:
conda env list
- namestitev paketov
conda install --quiet --yes pyyaml ipython scikit-learn tqdm
- odstranite okolje (če ga ne potrebujete več)
conda env remove -n myenvironment
V svojem poslu, samo določite okolje, ki ga želite uporabiti:
#!/bin/bash
#SBATCH -n 2
#SBATCH -N 2
#SBATCH -p cpu
#SBATCH --mem=XY
module load Anaconda3/2021.11
source activate myenvironment
python3 myjob.py
- spremeni okolje v condarc:
$ cat ~/.condarc
channels:
- defaults
ssl_verify: true
envs_dirs:
- /ceph/hpc/home/myusername/anaconda_envs
pkgs_dirs:
- /ceph/hpc/home/myusername/anaconda_envs